Nació el 6 de Abril de 1913, en Kanazawa, Japón, en una familia samurai de instructores de Kendo. Su padre, estudio judo y era medico del ejercito. Desde que el señor Nakayama se estableció en Taipei, Taiwan, fue allí donde el joven Masatoshi pasó sus años de la escuela primaria. Ademas de sus estudios académicos, se dedico a la practica de Kendo, Judo, natación, esquí, tenis y atletismo.
Su abuelo, Naomichi Nakayama, ademas de ser instructor de kendo, fue cirujano en Tokio. Naotoshi había seguido los pasos de su padre en la medicina y naturalmente esperaba que Matatoshi hiciera lo mismo.. El futuro maestro de karate -do sin embargo, había desarrollado un interés fuerte visitando y estudiando a china. Por consiguiente, presento en secreto los exámenes de ingreso a la universidad de Takushoku, que se especializaba en preparar a los estudiantes para trabajo extranjero.
En 1932, cuando Nakayama llego a Takushoku para empezar sus estudios pensó en continuar su practica de kendo. Pero, debido a que leyó mal el horario, se presento al Dojo cuando el equipo de Karate estaba practicando. Quedo fascinado por lo que vio y fue invitado a regresar a la próxima clase.
En esos momentos, Funakoshi estaba activo enseñando y el entrenamiento era agotador. Solo aproximadamente el 10 % de los estudiantes duraban mas de seis meses. Los entrenamientos consistían en 50 0 60 repeticiones de una sola kata, y alrededor de 1000 golpes al makiwara.
La generación de Nakayama se había formando practicando kendo o judo, así todos estaban acostumbrados a los varios tipos de encuentros donde se enfrentaban a un antagonista real.
Ademas de sus cinco horas diarias de practica de karate, Nakayama siguió un curso académico en historia y lengua china. Paso 3 o 4 meses en Manchuria durante 1933, como estudiante de segundo año, y regreso a china en 1937 en un programa de intercambio de la universidad de Pekín y se quedo a trabajar para el gobierno chino.
A su regreso a Japón, Nakayama encontró que varios de sus compañeros de karate, así como el propio dojo Shoto-kan, habían perecido en la guerra. El empezó a organizar clases de nuevo, y en mayo de 1949, ayudo a fundar la Asociación Japonesa de Karate ( JKA). Aunque funakoshi era la cabeza honoraria de la nueva organización, el tenia 81 años en el momento de la fundación y escogió a Nakayama como instructor principal de la JKA.
En 1947 Nakayama se convirtió en el entrenador del equipo de Karate de la universidad de Takushoku. En 1952 se le contrato como parte del personal de educación física y ascendería a director de esa dirección en el futuro. Entre sus muchos logros están la creación de una escuela de karate-do deportivo, el programa de entrenamiento de instructores de la JKA y la expansión del karate-do a Estados Unidos y el resto del mundo.
El 14 de abril de 1987, Masatoshi Nakayama murió a la edad de 74 años. Hasta su muerte, continuo viajando, enseñando, escribiendo libros sobre karate-do, y vigilando el devenir de la JKA, en una organización mundial de mas de 10 millones de personas en 155 países. El fue un verdadero maestro de Karate-do que absorbió completamente toda la filosofía, técnicas e ideas de Funakoshi, y gasto toda su vida transmitiendolas al mundo.