Diez años han pasado desde el final de Dragon Ball Z. Uubu entrena con Goku. Goten y Trunks son adultos. Pan tiene 14 años de edad.Bra tiene 15 años, Mr.Satan se esta quedando calvo. Krilin tiene el pelo gris y bigote. Vegeta y Bulma siguen juntos. Desde la derrota deMajin Buu, hay paz en la Tierra... Pilaf por fin ha conseguido reunir las Esferas del Dragon(estrañamente son negras) para pedirla dominación del Mundo.Shen Lon es conjurado. Goku esta entrenando en el templo sagrado con Uubu yal ver que el cielo se oscurece se dacuenta de que alguien esta utilizando las DB y se teletransporta .Gokuentra en escena. Pilaf, sorprendido de ver a Goku despues de tantos años, este se enfurece y desearia  que Goku vuelva a ser un niño para que asi fuera mas facil de derrotar. Shen Lon toma esto como un deseo y convierte a Goku de nuevo en niño. Pilaf huye de nuevo y nunca mas es vuelto a ver en la serie.

      Goku regresa a su hogar y platica lo que ha ocurrido. Mr. Popo aparece y le dice a Goku que hay Esferas del Dragon Negras se dispersas por todo el universo. Goku decide encontrarestas esferas para restaurarse a si mismo a su forma normal. (Las Esferas del Dragon de la Tierra solo pueden conceder una vez al año). Sorprendentemente, Mr. Popo platica que estas Esferas deben de ser reunidas dentro de un año o la Tierra explotara!!! Bulma le diseña a Goku una nave espacial para su busqueda ,Trunks y  Goten van a acompañarlo pero Goten por estar hablando por telefono con su novia se queda . Abordan la nave espacial para ponerse en camino a su nuevo reto. Pan se escurre dentro de la nave y accidentalmente enciende el motor. La capsula espacial se estrella en muchos planetas. En estos planetas, nuestros heroesadquieren la Esferas del Dragon y conocen a un repertorio de personajes no muy importantes. (Estas fueron las escenas aburridas que hicieron que la gente no les justaraDragon Ball GT en un principio). Durante estas escenas, Goku y Trunks se convierten a su forma de Super Saiyajin por primera vez en Dragon Ball GT para combatir a villanos menores.Pan tambien pelea, pero pasa la mayor parte del tiempo bservando a los Super Saiyajins en asombro. Ademas, nuestros heroes conocen a Giru, un pequeño robot que se trago el Radar del Dragon. Como resultado,  lo llevan en su viaje como el nuevo radar del dragon .

                  Nuestros heroes aterrizan en el planeta del Dr. Myuu. El Dr. Myuu es un malvado cientifico quien crea muchos androides y robots mutantes. Giru es una de sus creaciones. . Pan por error se va hacia otra planeta donde es combertida en muñeca , llegan a un planeta mientras en el que Goku y Trunks pelean contra  Ruudo, una creacion del Dr. Myuu. Ruudo es asesinado. despues llegan  al planeta natal de Giru  donde pelean con los robot mutantes de Myu y con el General Rildo el cual encierra aTrunks en una placa de metal y Trunks es secuestrado ,Goku tambien es encerrado igual que Trunks . Pan los rescata con ayuda de Giru  Trunk tras a escapar descubre el secreto de Myu el cual es Baby y Goku y los demas supuestamente lo destruyen y la tripulacion regresa al espacio.  Baby  sobrevivio escondiendose de en el cuerpo de Myu al cual elimina y confiesa que en realidad Baby es el creador de todos los robot mutantes . Baby es realmente el ultimo proyecto sobreviviente de los Tsufurujins. El Planeta Plant, su planeta  nativo, fue destruido por los Saiyajins cuando estos lo conquistaron y le cambiaron el nombre a Planeta Vegita , ya que su lider era el rey Vegeta .  Como unico sobreviviente, Baby busca venganza sobre todos los Saiyajins culpables. Dr. Myuu . Baby tiene el poder de tomar cuerpos y adquirir el poder de sus victimas.

Goku, Trunks, Pan y Giru finalmente regresan a la Tierra con las siete Esferas del DragonNegras . Goku las lleva a  Mr. Popo para que las asegure para su uso despues . Sin embargo, Baby tambien  ya habia aterrizado en la Tierra. Lentamente, toma los cuerpos de ,Gohan y Goten. Aun al dejar sus cuerpos, deja un huevo en su cerebro. Este huevo hace que su victima sea un esbirro de Baby. (Cuando Gohan era Gohan-Baby, el peleo contra Piccoro al cual lastimo seriamente). Baby finalmente encuentra un cuerpo que le satisface:el de Vegeta!!! El toma el cuerpo de Vegeta y Vegeta-Baby es formado!! En poco tiempo,todos en la Tierra se convierten en subditos de Baby a excepcion de Mr. Satan, Pan, Boo gordo , Uub y Goku . Mr. Popo al ser victima de Baby, utiliza las Esferas del Dragon Negraspara crear otro planeta , al cual llaman Plant 2 para Baby. (Para estas fechas, Dragon Ball GT se empezo a poner interesante) . Uub se  enfrenta a Vegeta-Baby y es derrotado. Boo gordo se une a la batalla y es derrotado . El cuerpo de Boo esta cerca de Uub y su espiritu entraen Uub  . Los dos se fusionan y Uub se da  cuenta de que el y Boo gordo originalmente eran uno solo. Sin embargo, aun y con esta fusion ,Uubu no es contrincante para Vegeta-Baby , el cual utiliza las esferas del dragon para crear un planeta al cual nombra Plant 2.

Goku se enfrenta a Vegeta-Baby. Vegeta-Baby es mas fuerte y facilmente derrota al joven Goku. Goku sube su poder hasta  Super Saiyajin 3, pero aun asi es derrotado; Vegeta-Baby tambien puede elevarse al nivel 3. Pan se esconde en los alrededores y observa la pelea. El derrotado de Goku es sacado de la pelea por  el supremo Kaiou. En el planeta de  supremo Kaiou, la cola de Goku esta creciendo de nuevo. (La cola es la principal fuente de energia de un Saiyajin segun entiendo). La cola de Goku crece parcialmente .  el supremo Kaiou sama le hala  la cola para que alcance el largo normal.

Goku regresa al planeta Plant 2 para enfrentarse a Vegeta-Baby. Despues de ser derrotado por Vegeta-Baby de nuevo, Goku cae en el suelo y observa a la Tierra. La "Tierra completa" actua como una Luna llena. Como resultado, Goku alcanza la etapa de Ohzaru y se convierte en una simio gigante dorado. (es dorado en lugar de negro ya que Goku esta en los maximos niveles de Saiyajin ). Goku es mas fuerte, pero es incapaz de controlarse en esta etapa de Ohzaru Dorado y destruye todo lo que esta a la vista ya que no razona . Vegeta Baby no puede derrotar al Ohzaru dorado . Posteriormente Pan trata de hacer entrar a Goku en razon al mostrarle una foto de su familia ,Goku reconoce a su familia y comiensa a razonar  y adquirir conciencia , de pronto un cambio comienza a ocurrir y Goku se comiensa a hacer pequeño y transformarse en un adulto de cabello negro y con casi todo el cuerpo cubierto de pelo rojo y cabello negro y se alcanza el Super Saiyajin 4. El giro de la batalla cambia y Vegeta-Baby se encuentra perdiendo. Bulma, como mala , crea un cristal que concentra los rayos de luz de la Tierra  para ayudar a su esposo.Vegeta-Baby alcanza  la etapa de Ohzaru Dorado . Goku no puede con esta forma y esta siendo derrotado  una vez mas. Mientras tanto, el supremo Kaiou sama descubre que el agua Ultra sagrada puede quitar a la gente del control de Baby.

   El parte al Templo sagrado de Kamisama para obtener el agua. Dende y Mr. Popo son curados en el forcejeo en contra del supremo Kaiou sama. Esta agua es esparcida a todos. Gohan, Goten, Trunks, (ahora libres del control de Baby) y Pan rodean a Goku formando un circulo. Su energia esdonada a Goku. Goku y Vegeta-Baby se enfrentan el uno al otro una vez mas. Goku hace un  10 veces Kamehame-ha y debilita a Vegeta Baby ,y posteriormente lo derrota a Vegeta-Baby.Baby abondona el cuerpo de Vegeta y escapa a su capsula espacial, pero Goku la destruye y al no sentir el Ki de Baby sabe que esta muerto .

            La Tierra esta a punto de explotar porque la Esferas del Dragon Negras no fueron empleadas para pedir la estabilidad de la Tierra. Goku y los demas llevan a todos los habitantes hacia el planeta Plant 2. Piccoro decide permanecer en la Tierra para morir con ella por que dice que ahora son uno mism y se despide de Gohan. La Tierra explota, y Piccorocon ella. Al ser reunidas las Esferas del Dragon de Namek y la Tierra es restaurada como deseo, pero Piccoro aun esta muerto(ya que habia sido revivido anteriormente).
 
 

       En el infierno, Dr. Gero y Dr. Myuu se asocian y crean al Androide Super #17. Ellos abren un portal para emontarse en la tierra de los vivos y escapar a la Tierra. #17 se entera del plan y busca a #18 para que lo ayude ,al encontrarla esta se niega y de enfado #17 mata a Krilin .Super #17 busca a Androide #17 y ellos se fusionan en Super #17Perfect cuando Goku pelea contra Super # 17 Perfect entra al infierno y el portal se cierra quedandose atrapado . Cell y Freezer también estan n el infierno y tratan de vengarse de Goku . Vegeta pelea contra Super 17 Perfect  y se derrotado . Durante la batalla,  a pesarde estar bajo el dominio del Dr. Myuu, Super #17 asesina al Dr. Gero. Después, Dr. Myuu también es traicionado y es asesinado. Sin embargo, la Androide #18 también ha perecidoen la batalla para vengar a su esposo. Entre tanto, Nappa escapó a Tierra y Vegeta lo matade nuevo. Goku derrota a Cell y Freezer,  Piccoro que está en cielo, causa males para ser enviado al infierno donde él puede ayudar a Goku a remontarse a Tierra. Con un truco de Namek, Piccolo y Dende crean un portal que le permite a Goku entrar de nuevo a la Tierra.La batalla entre Goku y Super #17 Perfect comiensa. Goku utiliza todas sus habilidadespero no lo puede derrotar ni aun en SSJ4 ,utiliza la Revenge Death Ball y el Kame hame ha pero no lo puede vencer ya que el Super #17 Perfect adsorve la energia de los ataques de Goku , pero este no puede contratacar mientras adsorve energia , asi que #18 lanza rafajas de energia pra distraer a Super 17 Perfect ,entonces Goku se teletransporta en frente #17 y lo atravieza con el Sho-ryu-ken Bukamatsu (golpe de Dragon dorado) despues Goku utilizael Kame hame ha destruye a Super 17 Perfect .

      Las Esferas del Dragon son reunidas para devolver Krilin a la vida .Cuando Shen Lon es conjurado, algo está mal. Un Shen Lon malo aparece y se ríe perversamente. Nuestros héroes aprenden que las Esferas del Dragon se corronpido debido a la energía negativaque guardó dentro de las esferas cuando se hicieron deseos negativos. Una nube aparece alrededor del Shen Lon malo, y se transforma en siete dragones malos, cada uno de una Esfera del Dragon. Los dragones salen volando en direcciones diferentes y crean el caos. Cada dragón tiene su propio elemento. Cuando encuentra que el elemento, asumirá su verdadera forma.

   Goku y Pan vuelan fuera de para luchar estos dragones. Primero, ellos encuentran Ryan-Shen Lon.  Ryan-Shen Lon dice que él nació cuando Bora se deseó a la vida. Estedragón de la esfera de 2 estrellas es de contaminación en el agua. Se engañó en nadar enagua limpia. Después de que fue debilitado por esta acción, Goku y Pan atacan  y lo matan. La esfera de 2 estrellas se restaura.

Luego, Goku y Pan siguen la señal del radar del dragón y encuentran Uu-Shen Lon. Nació en la esfera de 5 estrellas cuando Goku se deseó a la vida para luchar contra Raditz. Este dragón de electricidad se debilitó en la lluvia y se destruyó en su estado debilitado. La esfera de 5 estrellas se recupera.  Ryuu-Shen Lon es el que aparece ahora. Este dragón nació cuando Oolong hizo el deseopor la ropa interior de mujer mientras escapaba de Pilaf. Este dragón posee el poder delos huracanes. Goku aprende de su debilidad y lo ataca en la cabeza. Ryuu-Shen Lon fue derrotado fácilmente y la esfera de 6 estrellas fue restaurada.

Siguiendo esto, Goku y Pan vuelan hacia Chii-Shen Lon que nació de la esfera de 7 estrellas cuando todas las personas matadas por Majin - Vegeta se desearon a la vida. Pan es engañada y es atrapada dentro del cuerpo del dragón. Goku la rescata y destruyeChii-Shen Lon. Otra esfera es  recuperada.

Suu-Shen Lon es el siguiente para Goku y Pan encontrar. Nació cuando el Piccoro originalfue reguvenesido . Este dragón del sol es asociado con la esfera de 4 estrellas. Desafía aGoku en una pelea y los dos luchan. De repente, San-Shen Lon, el hermano de Suu-ShenLon y de la esfera de 3 estrellas, aparece. Después de ser mofado por su hermano porperder el honor al interferir con la pelea, el dragón de hielo lucha contra Goku sinembargo. Es derrotado en la batalla, y Goku y Suu-Shen Lon continúan su pelea. Goku admira el sentido de Suu-Shen Lon de honor.

La pelea se interfiere de nuevo cuando otra tercera persona mata a Suu-Shen Lon. Esta persona es Li Shen Lon, de la esfera de una estrella. Goku lo derrota en estado de Super Saiyajin 4, pero el dragón sobrevivio. Derrota a Pan y roba todas las esferas restauradas.Li-Shen Lon se fusiona con las esferas y se vuelve mas fuerte.Goku en SSJ 4 no es ningún contrincante para Li Shen Long en su estado actual .

Bulma creó un rayo especial que le permitió a Vegeta alcanzar el Super Saiyajin 4 .Vegetase une a Goku en la batalla. Los dos todavía no son ningún contrincante para Li-Shen LongLa  estrategia  que Goku piensa es fusionarse con  Vegeta  y se vuelven Gogeta SSJ4 .Li-Shen Long ya no es rival para Gogeta  y es derrotado y se restauran las esferas con lasque se fusiono, pero la fusión de Gogeta se deshace antes de que Li-Shen Long sea asesinado.Li-Shen Long se fusiona de nuevo con las esferas, pero Goku se traga la esfera de 4estrellas antes que Li-Shen Long   pueda fusionarse con ella.Goku es golpeado y escupe laesfera y Li-Shen Lon la absorbe. Vegeta sugiere usar la fusion de nuevo, pero Goku se encuentra demasiado débil para llegar al SSJ4. Por consiguiente, él permanece en su tamañopequeño; él no se puede fusionar con Vegeta en este estado debido a las diferencias del poder. Li-Shen long se prepara para matar a Goku y Vegeta.

    Una última oportunidad de esperanza. Goku empieza a crear un Henki-Dama. Todosen   la Tierra alzan sus manos para donar energía a Goku. Goku se teleporta con Kaiou-sama y pregunta que la energía no es bastante. Los Kaiou-samas están de acuerdo en ayudar en la busca de formas de vida por la galaxia para ayudar a que donen energía aGoku. Se muestran todos los personajes encontrados en espacio en la Saga de Baby de nuevo y ellos levantan sus manos. La gigantesca Henki-Dama de Goku se crea  y se lanzada a Li Shen long la cual lo destruye .

                    Todas las Esferas del Dragon se restauran a la normalidad, pero algo está mal. Shen Long aparece sin convocarse y dice que que él no hará más deseos debido a todo el problema que las Esferas del Dragon han causado. Goku le convence que haga el deseofinal de restaurar a todos las personas muertos durante las luchas contra los dragones. El deseo se concede, Shen Long le dice a Goku que ya es hora . Milk y sus hijos van a casa para preparar una fiesta grande mientras esperando el retorno de Goku, desprevenidos de lo qué está pasando. Pan nota la ropa de Goku en la tierra y pregunta si su abuelo se ha ido para siempre. Vegeta reponde que si. En la espalda del dragón , Goku visita a los todos guerreros Z. Ten shin hans y Chaoz , Yam sha esta con Puar , Krilin esta en Kame House y Goku le dice que si quiere una ultima pelea , entonces el maestro Rochi se da cuenta de que Goku se esta despediendo de todos . Al final, Goku se queda dormido en el suelo y las Esferas del Dragon entran en Goku y Goku desaparece. Shen Long se enrolla a y vuela haciala cámara y la pantalla se pone blanca.

      Ahora después de 100 años dos niños se enfrentan Goku Jr. (el nieto de Pan) y Vegeta Jr.estan en el ultimo Tenkaichi Budokai. Los dos muchachos se transforman en Super Saiyajin yluchan. Pan es un espectadora en el público. Ella nota a Goku que mira la lucha al otro lado delestadio entre la multitud . Pan va hacia él, pero pierde a su abuelo en la muchedumbre. Gokullama a la nuve voladora y se aleja ; entonses comienzan a aparecer escenas de Dragon Ball , Dragonball Z y  GT como recordatoria de la vida de Goku .